Tupper 4pm seminar
Tuesday, October 7, 4pm
seminar speaker will be Egbert
Leigh, STRI 
What comparisons among
CTFS plots have taught us
about tropical forest
ecology
Conservation forum
Tuesday, October 7,
Conservation forum speaker
will be George Angehr, STRI,
1-3pm in the LMR
Panama's Museum of
Biodiversity and
Conservation 
Bambi seminar
Please check your e-mails for
information on the next
Bambi seminar on BCI.
Arrivals
Peter Funch and Soren
Faurby, University of Aarhus,
to study the geographic
variation in tidal tardigrades, at
Naos.
Corinne Richards, University
of Michigan, to study the
selection and the rapid
evolution of morphological
variation among Strawberry
poison-dart frogs of the Bocas
del Toro archipelago.
Katherine LeVan, University
of California at San Diego, to
study the food recruitment
communication of stingless
bees, on BCI.
Departures
Mary Jane West-Eberhard to
Gainsville, FL, to attend
meeting at the American
Entomological Institute. Then
to Washington, DC to attend
a meeting at the National
Academy of Sciences.
 STRI news
Smithsonian Tropical Research Institute, Panamá        www.stri.org        October 3, 2008
Bd crosses
Panama
Canal
Chytridiomycosis is a
globally emerging disease of
amphibians and the leading
cause of population declines
and extirpations at
species-diverse montane
sites in Central America. It
is caused by a fungal
pathogen Batrachochytrium
dendrobatidis (Bd),
responsible, in part for the
disappearance of the
Panamanian golden frog
Atelopus zeteki, in the wild.
A group of researchers
including STRI's research
associate Roberto Ibáñez and
McGill graduate student Laura
L. Kilburn doing research at
STRI, are following the path of
the fungi. They just reported
the presence of Bd at Altos de
Campana National Park and
east of the Panama Canal in
Soberanía National Park. Their
results suggest that Panama's
diverse and not fully described
amphibians communities east
of the canal are at risk.
Precise predictions of future
disease emergence events are
not possible until factors
underlying disease emergence,
such as dispersal, are
understood. However, if the
fungal pathogen spreads in a
pattern consistent with
previous disease events in
Panama, then detection of Bd
at Tortí and other areas east of
the Panama Canal is imminent.
Therefore, development of new
management strategies and
increased precautions for
tourism, recreation, and biology
are urgently needed. 
The article, “Chytridiomycosis
and amphibian population
declines continue to spread
eastward in Panama” by
Douglas C. Woodhams from
the University of Zurich, et al.
was published by EcoHealth. It
can be seen at:
http://www.springerlink.com/c
ontent/u6l4775128852478/
The figure above shows an
elevation map projection of
Panama displaying sites and
dates of first detection of B.
dendrobatidis in amphibian
populations.
The group points out that at
tropical lowland sites,
chytridiomycosis may not be as
severe as at higher altitudes.
They suspect that amphibians in
the lowlands along the Panama
Canal may carry Bd without
developing clinical signs of
chytridiomycosis.
Quitridomicosis es una
enfermedad global emergente en
anfibios y la causa principal de
la disminución y desaparición de
la diversidad de especies
montanas en Centroamérica. Es
causada por un hongo
patógeno, Batrachochytrium
dendrobatidis (Bd), responsable en
parte por la desaparición de la
rana dorada panameña, Atelopus
zeteki, en su estado silvestre.
Un grupo de investigadores
incluyendo a Roberto Ibáñez,
1. Fortuna (Dec 1996)   2. Omar Torrijos, El Copé (Sep 2004)  3. El Valle (Apr
2006)  4. Altos de Campana (Jun 2006)  5. Soberanía (Jan 2007) 6. Parque
Natural San Francisco, Tortí (not detected) 
More departures
Ben Turner to Houston, TX,
to participate in the 2008 US
Soils conference.
New publications
Adair Gotaway, Patricia. 2008.
"Reproductive
compensation." Journal of
Evolutionary Biology 21(5):
1189-1200.
Baker, Timothy R., Phillips,
Oliver L., Laurance, William
F., Pitman, Nigel C.A.,
Almeida, Samuel, Arroyo,
Luzmila, DiFiore, Anthony,
Erwin, Terry L., Higuchi,
Niro, Killeen, Timothy J.,
Laurance, Susan G.,
nascimento, Henrique E.M.,
Monteagudo, Abel, Neill,
David A., Silva, Jose Natalino
Macedo, Malhi, 
Yadvinder, Lopez-Gonzalez,
G., Peacock, J., Quesada,
Carlos Alberto, Lewis, Simon
L., and Lloyd, Jon. 2008. "Do
species traits determine
patterns of wood production
in Amazonian forests?"
Biogeosciences Discussions 5(4):
3593-3621.
Bayona, German, Cortes,
Martin, Jaramillo, Carlos,
Ojeda, German, Aristizabal,
John Jairo, and Reyes-Harker,
Andres. 2008. "An integrated
analysis of an
orogen-sedimentary basin pair:
Latest Cretaceous-Cenozoic
evolution of the linked
Eastern Cordillera orogen and
the Llanos foreland basin of
Colombia." Geological Society of
America Bulletin 120(9-10):
1171-1197.
    
Heckadon Moreno, Stanley.
2008. "Alexander Wetmore y
Watson Perrygo en la Serranía
de Majé, 1950." "Épocas"
Tercera Era (Supplement to El
Panamá América) 23(9): 10-11.
investigador asociado de STRI
y a Laura L. Kilburn estudiante
graduada de McGill quien ha
llevado a cabo investigaciones
en STRI, le siguen la pista al
hongo. Acaban de informan
sobre la presencia de Bd en el
Parque Nacional Altos de
Campana y al este del Canal de
Panamá en el Parque Nacional
Soberanía. Sus resultados
sugieren que la diversidad de
anfibios de Panamá al este del
canal, que aún no se ha
descrito en su totalidad, se
encuentran en riesgo.
Predicciones precisas del
surgimiento de brotes futuros
de la enfermedad no son
posibles hasta que los factores
que determinan su
diseminación se comprendan
mejor. Sin embargo, si  el hongo
patógeno se prolifera con un
patrón consistente con brotes
previos de la enfermedad en
Panamá, el surgimiento de Bd en
Tortí y en otras áreas al este del
Canal de Panamá es inminente.
Por lo tanto es urgente que se
desarrollen nuevas estrategias de
manejo y se intensifiquen las
precauciones en el turismo,
recreación y biología.
El artículo, “Chytridiomycosis
and amphibian population
declines continue to spread
eastward in Panama”
[Quitridomicosis y las
disminuciones de poblaciones
de anfibios siguen
dispersándose al
este de Panamá] por Douglas C.
Woodhams de la Universidad de
Zurich y otros, fue publicado
por EcoHealth. Lealo en:
http://www.springerlink.com/c
ontent/u6l4775128852478/
El mapa en la página anterior
muestra una proyección de
elevaciones de Panamá mostran-
do lugares y las fechas donde se
detectó Bd por primera vez en
poblaciones de anfibios. El
grupo indica que en tierras bajas
del trópico la quitridiomicosis
no ha sido tan severa como en
otras altitudes. Sospechan que
los anfibios en tierras bajas a lo
largo del Canal de Panamá
portan el Bd sin desarrollar
síntomas clínicos de la
enfermedad.
Rare discovery in Gabon
SI scientists including STRI's
George Angehr led by Brian K.
Schmidt, from the National
Museum of Natural History
(see complete citation in “New
publications”) have discovered
and described a new bird
species unknown to science
from Gabon, Africa. Their
findings were published in
Zootaxa, on August 15.
The newly found olive-backed
forest robin (Stiphrornis
pyrrholaemus) was named by the
scientists for its distinctive
olive back and rump. Males
exhibit a fiery orange throat
and breast, yellow belly, olive
back and black feathers on the
head. Females are similar, but
less vibrant. Both sexes have a
distinctive white dot on their
face in front of each eye.
Discovering an unknown
mammal or bird species is far
from a common event. Before
the 20th century, the rate of
discoveries was great—several
hundred new species were
described each decade. Since
then the pace has slowed and
new species of vertebrates are
generally only found in isolated
areas. 
Now officially recognized, the
olive-backed forest robin
brings Gabon's number of
known bird species to 753.
Other than its existence, little is
known about this newcomer.
There is some knowledge about
the species' habitat choice since
all of the birds seen and heard
in the wild were found in dense
forest undergrowth. Other facts
such as specific diet, mating and
nesting habits, and the species'
complete habitat range are all
things that still need research.
Information taken from EurekAlert!
Científicos del Smithsonian
incluyendo a George Angehr de
STRI, liderados por Brian K.
Schmidt del Museo Nacional de
Historia Natural (vea la cita
completa en la sección de “New
publications”) han descubierto y
descrito una nueva especie de
ave en Gabón, África,
desconocida para la ciencia. Los
resultados de sus investigaciones
aparecieron en el número del 15
de agosto de Zootaxa.
El recién descubierto mirlo
(Stiphrornis pyrrholaemus) fue
bautizado por los científicos por
su distintivo lomo color oliva.
Los machos exhiben un fuerte
color naranja, un torso amarillo,
espalda oliva y plumas negras en
la cabeza.
Las hembras son similares pero
sus colores son menos
vibrantes. Ambos sexos tienen
un punto blanco distintivo en la
cara en frente de cada ojo.
Descubrir un mamífero o ave
desconocida está muy lejos de
ser un evento común. Antes del
siglo 20, la tasa de
descubrimientos era
enorme—varios cientos de
especies nuevas se descubrían
cada década. Desde entonces la
tasa se ha reducido y las nuevas
especies de vertebrados solo se
encuentran en áreas aisladas.
Ahora que está reconocido
oficialmente, el mirlo boscoso
de espalda oliva aumenta el
número de aves de Gabón a
753. Aparte de su existencia, es
poco lo que se sabe
científicamente sobre este
recién descubierto mirlo.
Se cuenta con algún
conocimiento sobre la
selección del hábitat de esta
especie ya que todas las aves que
se ven y se oyen en su estado
silvestre se encuentran en
bosques densos de arbustos y
otras plantas. Otros datos,
como una dieta específica, sus
hábitos de apareamiento y
nidación, y el rango completo de
su hábitat son información que
aún debe investigarse.
Tomado de EurekAlert!
STRI receives Graham
Palynological Collection
STRI received the best
collection of Neotropical
pollen in the world, the
Graham Palynological
Collection, thanks to the
generosity of Alan Graham,
professor emeritus at the Kent
State University and currently
curator at the Missouri
Botanical Gardens. 
This collection began as part
of a palynology laboratory set
up in the herbarium of the
University of Texas in 1954,
and expanded with original
preparations, and exchanges
with numerous laboratories
throughout the world. It
comprises over 25,000 pollen
slides of modern taxa,
thousands of pollen slides
from Graham's work on the
geological history of the
forests of Central America,
pollen residues and an
impressive collection of
literature. The original
preparations can be referenced
to a specific herbarium
collection, allowing scientists
to verify the identification of
fossil material and specimens
used in taxonomic studies.
STRI is honored to be hosting
this collection, which is an
invaluable resource to scientists.
“Soon, the CTPA plans to have
all components in digital format,
to share it on the web with
everyone who might be
interested, worldwide” states
STRI stratigrapher Carlos
Jaramillo.
STRI recibió la mejor colección
de pólenes del Neotrópico en el
mundo, la Colección
Palinológica Graham, gracias a
la generosidad de Alan Graham,
profesor emérito de Kent State
University y actual curador en
Missouri Botanical Gardens. 
La colección es parte de un
laboratorio de palinología
establecido en la Universidad de
Texas en 1954, y que se expan-
dió a través de preparaciones
originales e intercambios con
otros laboratorios alrededor del
mundo. Comprende 25,000
diapositivas de polen con taxa
moderna, miles de diapositivas
de polen del trabajo de Graham
sobre la historia geológica de los
bosques de Centroamérica,
residuos de polen y una
impresionante colección de
literatura especializada. Las
preparaciones originales pueden
referirse a herbarios específicos,
lo que permite a los científicos
verificar la identificación de
material fósil y los especímenes
usados en los estudios
taxonómicos.
Para STRI es un honor
mantener esta colección que es
un recurso invaluable para los
científicos. “El CTPA planea
tener todos los componentes de
la colección con formato digital
lo más pronto posible, para
compartirlos en la web con
cualquiera que esté interesado,
alrededor del mundo” aseguró
el estratígrafo de STRI, Carlos
Jaramillo.
Special visitors on BCI
Recently, STRI’s Human
Resources Office hosted the
visit of the Ministry of Labor
on BCI. Among the
participants were Labor
director Rodolfo Stanziola,
deputy director Antonio
Vargas and Contracts
Department chief Gabriel
Quintero. They were very
impressed with the research on
BCI, its facilities and our
guides. The Contracts
Department and the Office of
Labor Migration has been
invaluable to the activities of
STRI’s Human Resources
Office.
Recientemente, la Oficina de
Recursos Humanos de STRI
organizó una visita del
Ministerio de Trabajo a BCI.
Entre los participantes
estuvieron Rodolfo Stanziola,
director general de Trabajo, el
subdirector Antonio Vargas y el
jefe del Departamento de
Contrato, Gabriel Quintero. El
grupo se mostró positivamente
impresionado con las
investigaciones que se llevan a 
cabo en BCI, sus instalaciones y
nuestros guías. El
Departamento de Contratos y la
Oficina de Migración Laboral
han sido invaluables para la
actividades de la Oficina de
Recursos Humanos de STRI.
More publications
Helson, Julie E., Capson, Todd
L., Johns, Timothy, Aiello,
Annette, and Windsor, Donald
M. 2009. "Ecological and
evolutionary bioprospecting:
using aposemantic insects as
guides to rainforest plants
active against disease." Frontiers
in Ecology and the Environment
Online.
Laurance, William F. 2008.
"REDD Herring?" BioScience
58(8): 677.
Laurance, William F. 2008.
"Theory meets reality in
fragmented forests." Animal
Conservation 11: 364-365.
MacDonald, James A. 2008.
Variation among mangrove
forests as fish habitat: The role
of prop-root epibionts, edge
effects and behavior in
Neotropical mangroves. Ph.D.
thesis. Rutgers University, New
Brunswick, NJ.
Punyasena, Surangi W. 2008.
"Estimating Neotropical
palaeotemperature and
palaeoprecipitation using plant
family climatic optima."
Palaeogeography, Palaeoclimatology,
Palaeoecology 265(3-4): 226-237.
Sanhudo, C.E.D., Izzo, Thiago
J., and Brandao, C.R.F. 2008.
"Parabiosis between basal
fungus-growing ants
(Formicidae, Attini)." Insectes
Sociaux 55(3): 296-300.
Schmidt, Brian K., Foster,
Jeffrey T., Angehr, George R.,
Durrant, Kate L., and
Fleishcher, Robert C. 2008. "A
new species of African forest
robin from Gabon
(Passeriformes: Muscicapidae:
Stiphrornis)." Zootaxa
2008(1850): 27-42.
Wright, S. Joseph, and
Samaniego, Mirna. 2008.
"Historical, demographic, and
eEconomic correlates of
land-use change in the
Republic of Panama." Ecology
and Society 13(2): 17.
Adding pieces to the puzzle:
First geological survey of Panama's Kuna Yala coast
Smithsonian Tropical Research Institute         October 3, 2008
Story: Aaron O’Dea
Edited by Beth King
M Alvarado &
ML Calderon
Photos: Aaron O’Dea
and Beth King
STRI's research vessel,
Urraca, has returned
from the first-ever
geological survey of
Kuna Yala, Panama’s
autonomous
indigenous territory
that extends from the
Caribbean mouth of
the Panama Canal to
the Colombian border. 
The journey was
instigated by Tupper
post-doctoral fellow,
Aaron O'Dea (left inset)
paleontologist Félix
Rodríguez (right inset)
approved by the Kuna
General Congress and
paid for by Panama's
National Secretariat for
Science and
Technology
(SENACYT).
During the month of
September eight
geologists and
paleontologists
surveyed the entire
coast by zodiac from
the R/V Urraca and
explored river basins
on foot
Whereas previous
maps showed only two
geological zones, the
new survey classified
the coast into
approximately 15
zones.  
In striking contrast to
the Caribbean coast
west of the Canal,
where outcrops
consist of uplifted sea
sediments, most
outcrops along the San
Blas coastline are
volcanic in origin.
The team collected
over a ton of rock and
sediments which will
be used to date the
complex geological
events that led to the
highly fault-segmented
blocks of the
Caribbean coastline.
Data will add
significant pieces to
the puzzle of how,
where and when the
Isthmus of Panama
severed the tropical
American seaway and
linked the two
continents."
La embarcación de
investigaciones de
STRI Urracá, regresó
del primer estudio
geológico que se ha
hecho en Kuna Yala,
territorio indígena
autónomo que se 
extiende desde la
entrada del Canal de
Panamá en el Caribe,
hasta la frontera con
Colombia.
El viaje fue iniciativa
de Aaron O'Dea,
becario postdoctoral
Tupper de STRI y el
paleontólogo Félix
Rodríguez. Contó con
la aprobación de 
Congreso General
Kuna y fue financiado 
por la Secretaría
Nacional para Ciencias
y Tecnología de
Panamá (SENACYT).
Durante el mes de
septiembre, ocho
geólogos y
paleontólogos
examinaron toda la
costa en un zodiac y
exploraron los ríos.
Mientras que los
mapas anteriores
mostraban solo dos
zonas geológicas, el
nuevo estudio clasificó
la costa en
aproximadamente 15
zonas.
Haciendo un gran
contraste con la costa
caribe al oeste del
Canal, donde las
formaciones rocosas
visibles consisten de
sedimentos empujados
por el mar, la mayoría
de estas formaciones
en San Blas, son de
origen volcánico.
El equipo colectaron
más de una tonelada
de rocas y sedimentos
que se usarán para
fechar los complejos
eventos geológicos
que llevaron a
fragmentar y separar
estos bloques de la
línea costera del
Caribe.
La información añadirá
piezas significativas al
rompecabezas de
cómo, y cuando el
Istmo de Panamá
irrumpió el paso
marino tropical de
América uniendo dos
continentes.